《超级机器人大战·原创世纪》的背景是新西历，春暖人类正式开始进出宇宙2世纪，春暖但因为2次大型陨石的坠下，人们的生活还是维持在21世纪初。到了新西历179年，第3颗陨石“流星3(メテオ3)”坠落于南太平洋的マーケサズ群岛海面。地球连邦政府经过调查，发现是由人类未知的技术制造的物体，这种地球以外的技术被称为EOT(Extra over technology)。地球连邦政府组成了“EOT特别审议会”和“EOTI机关”进行调查。然后EOTI机关的代表比安博士发表了研究结果，表示地球有被宇宙以外的生命体侵略的危机。从此，人型机动兵器：Personal Trooper的研究开始了。
上田正树
回复 :来自异次元的种族MU占领了东京，并将城市隐藏在巨大的防护壁之后，他们欺骗在东京生活的人们他们已经成为世界上仅存的人类。在防护壁之外，名为“TERRA”的反MU组织声势渐渐壮大。某日，在同MU激烈交火之时，一位名为神名绫人（下野紘 配音）的平凡少年意外的来到了位于东京湾的地下神殿之中，在这里，绫人见到了巨型机器人“Rahxephon”，并且成为了它的驾驶者。在神秘女子的紫东遥（久川绫 配音）的带领下，绫人来到了防护壁之外，加入了TERRA，并且在那里遇见了名为如月久远（桑岛法子 配音）的女子。MU组织对TERRA发起了进攻，当TERRA的存亡陷入危机之中时，绫人再一次驾驶着Rahxephon，成为了这个组织的救世主。
严凤英
回复 :从前有位“光之巨人”，他负责保卫世界和平，对抗巨型怪物和外星人入侵的威胁。他就是机动奥特曼。他曾在执行任务时与科学考察队员早田进建立起联系，并在使命完成后离开了地球。时至今日，人类已进入了繁荣时代，但这只不过是和平的假象...现在，世界再次需要“光之巨人”的力量。就在这时，一个新的英雄出现了，他继承了光的基因。但是他并不高大，是一名中等身材、多愁善感的高中生，穿着金属动力制服。他的名字叫早田进次郎，是初代机动奥特曼早田进的儿子。早田进次郎克服种种困难成为新一代机动奥特曼，一个新的故事就此展开。
宇恒
回复 :平凡上班族竹林龙马（田所梓 配音）几乎没有过过一天舒心日子，39岁了还孑然一身，在黑心企业里为贪心的老板做牛做马。终于，在狭窄又潮湿的单身公寓里，他的生命走到了尽头，然而当龙马再度睁开眼时，发现自己竟然转生来到了异世界中，成为了一名年仅8岁的少年。 和凶险的现实社会相比，异世界里的生活虽然辛苦但充满了乐趣，龙马居住在森林里，埋头研究如何利用魔法来驯养野生的史莱姆。个性开朗的千金大小姐艾莉亚莉亚（桑原由气 配音）、喜欢舞刀弄剑的公爵莱因哈特（小野大辅 配音）、善良热情的魔兽使艾莉莎（早见沙织 配音），在这个世界里，龙马很快就交到了朋友。
